В структуре научно-клинического объединения функционирует поликлиника и ряд специализированных отделений: гастроэнтерология, онкопроктология, оперблок и др. Обследование пациентов проводится посредством эндоскопии, лучевой диагностики, микробиологических исследований и с использованием ресурсов клинико-химической лаборатории.

К услугам посетителей Центра Колопроктологии в Москве доктора, специализирующиеся на общей и реконструктивной проктологии, эксперты в области неотложной помощи, анестезии и реанимации. Помимо этого в штате сотрудников имеются врачи, предоставляющие грамотные и развернутые консультации по вопросам колопроктологии.